La ejecución del gasto en I+D en el año 2006 por sectores correspondió en un 79,5% a las empresas, seguido por un 17,2% por la investigación universitaria y el 3,3% restante a diversos organismos públicos.

El esfuerzo en la I+D empresarial en Euskadi se debe, en gran medida, a la naturaleza de su sistema productivo, con un gran peso del sector industrial, donde una buena parte de las empresas están sensibilizadas sobre la necesidad de la innovación tecnológica.

La disciplina científica en que se realiza mayor gasto y que emplea al mayor número de personal es la de ingeniería y tecnología, ya que a ella se destina el 73,60% de los recursos y ocupa al 70,68% del personal dedicado al I+D.

Centrándonos en empresas industriales, cabe destacar a la maquinaria y equipo mecánico; a la construcción aeronáutica y espacial; y a manufacturas metálicas como productos investigados de mayor relevancia. Entre estos sectores consumen el 24% de todos los gastos corrientes dedicados a I+D por las empresas.

Por parte de las empresas de servicios son las telecomunicaciones, el software y los servicios de I+D, los productos a los que se dedican mayores recursos, alcanzando entre todos un 19% de los gastos corrientes dedicados a I+D.